CristalO : Plateforme de cristallogenèse et de cristallographie
Activité générale
La plateforme CristalO détermine la structure tridimensionnelle à l’échelle atomique de protéines et complexes protéiques par cristallographie aux rayons X.
CristalO regroupe le service de cristallogenèse et le service de cristallographie :
La cristallogenèse est la première étape vers la résolution de structure par cristallographie. Elle consiste à trouver les conditions physico-chimiques qui permettent à une protéine concentrée soluble de passer à un état solide et ordonné et ainsi former le cristal de protéine.
L’utilisation du robot nano-goutte Gryphon, permet de cribler de nombreuses conditions sur le principe de l’échange gazeux (jusqu’à 2700 conditions). Les cristaux sont ensuite reproduits et optimisé manuellement par diverses techniques adaptées à chaque projet.
La cristallographie consiste en la collecte des données de diffraction des rayons X au synchrotron. Ces données sont ensuite analysées via de nombreux logiciels de cristallographie, disponibles sur la plateforme, jusqu’à la détermination de la structure tridimensionnelle de la protéine. Après l’analyse, la structure est déposée dans la PDB.
CristalO regroupe le service de cristallogenèse et le service de cristallographie :
La cristallogenèse est la première étape vers la résolution de structure par cristallographie. Elle consiste à trouver les conditions physico-chimiques qui permettent à une protéine concentrée soluble de passer à un état solide et ordonné et ainsi former le cristal de protéine.
L’utilisation du robot nano-goutte Gryphon, permet de cribler de nombreuses conditions sur le principe de l’échange gazeux (jusqu’à 2700 conditions). Les cristaux sont ensuite reproduits et optimisé manuellement par diverses techniques adaptées à chaque projet.
La cristallographie consiste en la collecte des données de diffraction des rayons X au synchrotron. Ces données sont ensuite analysées via de nombreux logiciels de cristallographie, disponibles sur la plateforme, jusqu’à la détermination de la structure tridimensionnelle de la protéine. Après l’analyse, la structure est déposée dans la PDB.
Description
Catégories
Analyses, essais à terre et sites de tests pour l'ingénierie et l'observation des océans
Analyses, mesures et métrologie
Analyses, mesures et métrologie
Autre(s) catégorie(s)
Disciplines scientifiques
Biochimie marine / Biogéochimie marine / Chimie marine
Biologie moléculaire / Biologie cellulaire
Bioinformatique
Biologie moléculaire / Biologie cellulaire
Bioinformatique
Exemples de travaux
Reisky L, Préchoux A, Zühlke MK, Bäumgen M, Robb CS, Gerlach N, Roret T, Stanetty C, Larocque R, Michel G, Song T, Markert S, Unfried F, Mihovilovic MD, Trautwein-Schult A, Becher D, Schweder T, Bornscheuer UT and Hehemann JH. A marine bacterial enzymatic cascade degrades the algal polysaccharide ulvan. Nat Chem Biol. 2019. 15(8):803-812.
Type d'entité
Plate-forme
Mots-clefs
cristallogenèse, cristallographie des rayons X, détermination de structure 3D de protéines et complexes protéiques
Site internet
Date de modification: 08/04/2025 22:09:37
Cristallogenèse
Publics concernés
Entreprises
Partenaires de recherche
Autres chercheurs
Tous publics
Administrations
Autres
Partenaires de recherche
Autres chercheurs
Tous publics
Administrations
Autres
Modalités d'accès
Collaboration de recherche
Prestation complète
Prestation complète
Mobile ?
oui
non
Description
C'est au sein du service de Cristallogenèse qu'est réalisé la formation de cristaux à partir d’une protéine soluble. L’identification des conditions de cristallisation est réalisée de façon automatique par un robot de cristallisation. Ensuite intervient une étape manuelle de reproduction et d’optimisation des cristaux.
Cristallographie
Publics concernés
Entreprises
Partenaires de recherche
Autres chercheurs
Tous publics
Administrations
Autres
Partenaires de recherche
Autres chercheurs
Tous publics
Administrations
Autres
Modalités d'accès
Collaboration de recherche
Prestation complète
Prestation complète
Mobile ?
oui
non
Description
C'est au sein du service de Cristallographie que les cristaux sont pris en charge et sont étudiés par diffraction des rayons X. Les données sont ensuite collectées et traitées ce qui permet la détermination de la structure 3D et son affinement.
La Station Biologique de Roscoff est un centre de recherche et d'enseignement en biologie et écologie marines . Elle dépend du Cnrs et de Sorbonne Université
RORET Thomas
Adresse
Place Georges Teissier
Complément d'adresse
Station Biologique de Roscoff - CS 90076
Code postal
29688
Commune
ROSCOFF
