GENOMER : Plateforme de génomique
Activité générale
La plateforme Genomer développe des applications autour de thématiques environnementales : l'analyse de la diversité infraspécifique (génomique des populations, découverte de SNPs, génotypage haut débit), la génomique et la transcriptomique. Au-delà du séquençage massif, la plateforme est impliquée dans le développement de protocoles liés aux spécificités des modèles marins.
Après formation, les utilisateurs ont accès en autonomie à nos équipements de pointe.
Plateforme Biogenouest.
Après formation, les utilisateurs ont accès en autonomie à nos équipements de pointe.
Plateforme Biogenouest.
Description
Certification, normalisation, calibration
Démarche qualité
Catégories
Analyses, essais à terre et sites de tests pour l'ingénierie et l'observation des océans
Analyses, mesures et métrologie
Analyses, mesures et métrologie
Autre(s) catégorie(s)
Disciplines scientifiques
Biologie moléculaire / Biologie cellulaire
Génomique / Génétique
Génomique / Génétique
Domaines d'action stratégiques
Environnement et valorisation du littoral
Ressources biologiques marines
Ressources biologiques marines
Exemples de travaux
Réseau européen ASSEMBLE+. Projet IDEALG. Dittami et al. (2016). Host-microbe interactions as a driver of acclimatation to saliny gradients in brown algam cultures. The ISME Journal 10, 51-63.
Type d'entité
Plate-forme
Mots-clefs
ADN, ARN, metagenomique, métatranscriptomique, séquençage haut-débit, NGS, amplicons, génotypage, environnement
Site internet
Date de modification: 09/04/2025 00:18:32
Mise à disposition d'équipement (MAD)
Publics concernés
Partenaires de recherche
Modalités d'accès
Environné
Libre
Libre
Mobile ?
oui
non
Description
La plate-forme GENOMER met à disposition de l'utilisateur des équipements. Certains équipements nécessitent une habilitation avant toute utilisation. Elle est dispensée par le personnel de la plate-forme après formation de l'utilisateur
Production de banques
Publics concernés
Entreprises
Partenaires de recherche
Autres chercheurs
Tous publics
Administrations
Autres
Partenaires de recherche
Autres chercheurs
Tous publics
Administrations
Autres
Modalités d'accès
Collaboration de recherche
Prestation complète
Environné
Prestation complète
Environné
Mobile ?
oui
non
Description
Conduite de projet en génomique (CPG) assurée par le personnel, préparation de vos échantillons et production de banque en amont du séquençage haut-débit. a plate-forme Genomer est ouverte à la communauté scientifique de Biogenouest, et, plus largement, aux laboratoires académiques Français et étrangers. Après analyse de la « Fiche Contact » complétée et discussion avec l'utilisateur, la faisabilité du projet est examinée par l'équipe de la plateforme Genomer
Réalisation de séquençage haut débit
Publics concernés
Entreprises
Partenaires de recherche
Autres chercheurs
Tous publics
Administrations
Autres
Partenaires de recherche
Autres chercheurs
Tous publics
Administrations
Autres
Modalités d'accès
Collaboration de recherche
Prestation complète
Environné
Prestation complète
Environné
Mobile ?
oui
non
Description
Conduite de projet en génomique (CPG) assurée par le personnel comprenant le séquençage haut-débit de vos échantillons. La plate-forme Genomer est ouverte à la communauté scientifique de Biogenouest, et, plus largement, aux laboratoires académiques Français et étrangers. Après analyse de la « Fiche Contact » complétée et discussion avec l'utilisateur, la faisabilité du projet est examinée par l'équipe de la plateforme Genomer
La Station Biologique de Roscoff est un centre de recherche et d'enseignement en biologie et écologie marines . Elle dépend du Cnrs et de Sorbonne Université
TANGUY Gwenn
Adresse
Place Georges Teissier
Complément d'adresse
Station Biologique de Roscoff - CS 90077
Code postal
29680
Commune
ROSCOFF
