GENOMER : Plateforme de génomique
Description
Type d'entité Plate-forme
Détail activité / Présentation générale La plate-forme Genomer développe des applications autour de thématiques environnementales : l'analyse de la diversité infraspécifique (génomique des populations, découverte de SNPs, génotypage haut débit), la génomique et la transcriptomique. Au-delà du séquençage massif, la plate-forme est impliquée dans le développement de protocoles liés aux spécificités des modèles marins. Après formation, les utilisateurs ont accès en autonomie à nos équipements de pointe.
Mots-clés ADN, ARN, metagenomique, métatranscriptomique, séquençage haut-débit, NGS, amplicons, génotypage, environnement
Label(s) Biogenouest
EMBRC-ERIC
EMBRC-France
IBiSA
Infrastructure de Recherche (I.R.) du MESRI
Site internet Plug in labs Ouest
Entités rattachées
Analyseur de fragments applied 3130xl
Bioanalyzer
Covaris M220
Labchip GXT
Lecteur de plaque Spark
Lightcycler 480
MiNion
MiSeq
Pippinprep
Qubit 2.0

Services
Mise à disposition d'équipement (MAD)
Production de banques
Réalisation de séquençage haut débit
Propriété de / opéré par
Site internet Station Biologique Roscoff
Localisation et contact
TANGUY Gwenn
Téléphone référent +33 (0)2 98 29 56 65
Email Envoyer un email
Adresse Station biologique de Roscoff - Place Georges Teissier
Complément d'adresse CS 90074
Code postal 29688
Commune ROSCOFF
Services
Service : Mise à disposition d'équipement (MAD)
Service proposé Mise à disposition d'équipement (MAD)
Description du service La plate-forme GENOMER met à disposition de l'utilisateur des équipements. Certains équipements nécessitent une habilitation avant toute utilisation. Elle est dispensée par le personnel de la plate-forme après formation de l'utilisateur
Publics concernés Partenaires de recherche
Modalités d'accès Libre
Environné
URL modalités d'accès http://www.sb-roscoff.fr/fr/station-biologique-de-roscoff/services/plateformes-technologiques/plateforme-de-genomique/prestations-plateforme-genomer
Conditions particulières
Mobile ? oui non
Service : Production de banques
Service proposé Production de banques
Description du service Conduite de projet en génomique (CPG) assurée par le personnel, préparation de vos échantillons et production de banque en amont du séquençage haut-débit. a plate-forme Genomer est ouverte à la communauté scientifique de Biogenouest, et, plus largement, aux laboratoires académiques Français et étrangers. Après analyse de la « Fiche Contact » complétée et discussion avec l'utilisateur, la faisabilité du projet est examinée par l'équipe de la plateforme Genomer
Publics concernés Tous publics
Entreprises
Partenaires de recherche
Autres chercheurs
Administrations
Autres
Modalités d'accès Environné
Collaboration de recherche
Prestation complète
URL modalités d'accès http://www.sb-roscoff.fr/fr/station-biologique-de-roscoff/services/plateformes-technologiques/plateforme-de-genomique/prestations-plateforme-genomer
Conditions particulières
Mobile ? oui non
Service : Réalisation de séquençage haut débit
Service proposé Réalisation de séquençage haut débit
Description du service Conduite de projet en génomique (CPG) assurée par le personnel comprenant le séquençage haut-débit de vos échantillons. La plate-forme Genomer est ouverte à la communauté scientifique de Biogenouest, et, plus largement, aux laboratoires académiques Français et étrangers. Après analyse de la « Fiche Contact » complétée et discussion avec l'utilisateur, la faisabilité du projet est examinée par l'équipe de la plateforme Genomer
Publics concernés Tous publics
Entreprises
Partenaires de recherche
Autres chercheurs
Administrations
Autres
Modalités d'accès Environné
Collaboration de recherche
Prestation complète
URL modalités d'accès http://www.sb-roscoff.fr/fr/station-biologique-de-roscoff/services/plateformes-technologiques/plateforme-de-genomique/prestations-plateforme-genomer
Conditions particulières
Mobile ? oui non
Description
Catégorie(s) Analyses, essais à terre et sites de tests pour l’ingénierie et l’observation des océans
  Analyses, mesures et métrologie
Disciplines scientifiques Biologie moléculaire / Biologie cellulaire
Génomique / Génétique
Domaines d'action stratégiques Ressources biologiques marines
Environnement et valorisation du littoral
Certification, normalisation, calibration Démarche qualité
Exemples de travaux Réseau européen ASSEMBLE+. Projet IDEALG. Dittami et al. (2016). Host-microbe interactions as a driver of acclimatation to saliny gradients in brown algam cultures. The ISME Journal 10, 51-63.
Propriété de / opéré par
Site internet Station Biologique Roscoff
La Station Biologique de Roscoff est un centre de recherche et d'enseignement en biologie et écologie marines . Elle dépend du Cnrs et de Sorbonne Université
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